任務2：生死通道(The Gateway)

由開始的營地往西走找到9號營地，在里面見到煽動叛亂的主謀Liu Han，他稱帝國和將軍隱蔽了真相。任務開始往東北邊跑，敵軍的巡邏戰車很快會開往巨坑，避開他們。往前拾到Chaingun，相近有水晶和金屬資源，派工程車(Dron)在相近修建基地，電廠(Power Plant)生產電能，技術工廠(Engineering Facility)用來科研開發，能量發射器(Energy Transmitter)用來為籠罩半徑的范圍傳送能量，精煉廠(Refinery)處理采礦車收集的資源，在這些修建底子上還可增加升級的組件提高效能，比如在技術工廠增加輕型工廠(Light Unit Factory)可生產銀甲士兵，增加重型工廠(Heavy Unit Factory)可生產機器人等重裝甲單元。在開始有兩輛采礦車位于地圖西北和東北，將它們調過來收集水源和水晶，途中避開地圖中央的敵軍基地。

生產一定兵力后朝地圖中央進發，那里分東西兩座大院，西側是生產基地，它要首先要掃除掉，并留守兵力防備大張旗鼓。率領50名左右的兵力攻擊敵軍的營地，帝國基地在地圖的東北角，UCS的基地在正南方，將兩座基地摧毀，完成任務。在最里層是有堅固圍墻的高臺，最頂端就是要摧毀的目標，不過任何兵種的武器都打不到它，目前的科技還建不了機場，將里層圍墻拆掉在上面建炮塔，或者召喚傭兵的坦克到圍墻里面打，把加農炮修建的血打光，完成任務。

任務3：行星落難(Wreckage)

本關的地圖是環拱中央的彎曲山道，正中央即是要尋找摧毀的巨型修建物。在地圖的4個角落都有礦藏，尤其西北角的礦脈非常豐富，只是礦藏的位置都比較狹小，倒霉于大范圍地發展部隊，建議在開始都搜索霸占。在開始霸占四角的礦區，大力發展兵力，率軍朝中央的修建進發地球2160。如果科技發展到一定程度，基地可生產會投彈的機器蜘蛛(Scorpion 1)，可在山道上直接將修建炸毀，否則要沖過彎曲的盤山道，與巨大艦艇和環繞中央的異種巢穴作戰。

任務4：失落靈魂(The Lost Soul)

在這座行星上接收到兩組迥然不同的信號，信號的署名都是帝國部隊，為此Michael率隊調查信號的來源。由起始點往東走，遇到一群從地球逃亡的軍人，一組信號正是他們發出的。

起始基地的資源緊張，等敵軍進攻松懈后，抽調兵力往西側的道路搜索，霸占那里的水晶礦，盡快地在相近修好防空炮塔，并留戰車在此防守，敵軍的戰機和投彈車會很快抵達。

救完6名戰俘后，糾集兵力分別攻奪東北和西北的兩座敵軍基地，最后攻打正北的監獄，派Ariah跑到監獄觸發劇情，最后護送Michael和Liu Han抵達不遠處的撤離點，任務完成。召喚傭兵的裝甲卡車，率全軍從一側殺入仇人基地，重點摧毀防空炮塔，搶入基地深處派步兵進入那輛載有探測器的卡車，再沖出基地，護送卡車回到我方基地，完成任務。

任務5：隱秘迷宮(Hidden Star)

追尋另一組信號的來源，Michael率隊進入行星的一處遺跡。進入一片工業區域，在這里制作基地，派Michael到相近搜索重型化學鎧甲，然后發展軍事。率部隊往地圖的正中找到一片基地，與ED軍官對話，Michael打算借用他們的發電機脫離行星的傳送門，不想軍官質問通行密碼，Michael無奈只好以武相犯。

將基地的所有修建拆光，這時收到來自Liu Han的信息，得知Sebastian博士會利用傳輸機來到這片迷宮，立即移軍至地圖的西北方找到傳輸機的位置，一群異種正在圍攻可憐的Sebastian，替她解圍后留守片刻，從兩個路口陸續有異種沖擊過來，擊退它們將Sebastian帶到我軍基地休息，休整部隊朝地圖的東部搜索渣滓的異種，將異種和巢穴掃除干凈，完成任務。

任務6：地獄哀歌(Eden)

關卡開始降落在被稱為伊甸的星球上，由Ariah帶隊前往LC的基地。由島嶼的西南往東北方向探索，在地圖中部找到LC的基地，里面寂無人聲，但發電機等設備仍事情著。進入基地搜索到一名幸存的事情人員，聲稱這里已變為地獄，原來這個研究所在地下找到了古老文明的遺跡，利用那里的遺傳物質和孵化艙培養出異種生物，它們不受控制的脫繭而出造成這里的災禍。

建立基地生產兵力，多生產能打空陸兩種仇人的機甲，如機器蜘蛛。率軍朝小島的東北端行進，那里會遭遇大片的異種巢穴，并且還有兩艘巨大的攻擊艦船，將它們清除干凈，結束任務。

任務7：拯救伊甸(Eden free)

任務開始時位于地圖西北的谷中，將所有兵力調到谷口鎮守，在谷中建立基地發展生產，路口修建炮塔。率部隊出谷往東南走到一處山坳收到Van Troff博士的信息，他和一群士兵加入異種的陣營，做起統治宇宙的美夢。

Ariah從此走上背叛之路。往南的道路縱橫交錯，每個路口都有水晶和金屬資源地球2160。逐個路口霸占，留守少量兵力把守并建立基地，將戰線往南推移。異種的大本營在地圖的東南角，那里有3艘戰艦守護，摧毀它們控制整個版圖。遠處傳來Van Troff博士陰森的笑聲，揚言成為宇宙之皇的時候來臨了，與此同時Michael被Van Troff博士捉捕，帶上了遠征的艦隊。

Alien戰役

任務1：變異蘇醒(The Awakening)

Michael被Van Troff博士改造成了異種人，成為惟命是從的戰爭機器。先聽博士講解異種克隆技術，注意異種的底子單位是女巫(Mantian Lady)，在其底子上進行克隆和進化，在任何情況下最少要保留一個女巫，是這個種族的火種和希望。每種生物都有獨特的轉化的路線，不需要特別進行科技研究，別的異種在克降和轉化過程需要水源的支持。

異種可成倍地克隆，發展起來很快，沒有數量的限制可打人海戰術。東側是大型加農炮的院落，圍墻層疊并筑有大量的炮塔，要警惕地逐層掃除。

任務2：隱蔽迷宮(Hidden Star)

研究所(Research Center)用來發展科技，開發運輸機(AN-85)和火箭技術(Rocket Technology)便可生產火箭兵了。此時起始點的兵力已發展到可觀范圍，等克隆四五艘巡洋艦之后，全軍朝地圖中央的ED基地發動總攻，巡洋艦著重炸毀圍墻上的防御塔，陸軍則清除士兵并拆修建。

任務3：生死防御(Eden)

任務開始遭受UCS部隊的攻襲，把守起始的位置直至增援艦隊抵達，其間仇人會有六七次進攻，將所有可集合的部隊頂在前方，等前方的巢穴被毀，立即后撤到下一道巢穴防御線。在近20分鐘后博士派來的艦隊抵達，就近找水晶礦給艦隊升級轉化，然后糾集所有艦只朝西北方UCS的兩座基地進攻，這幾艘戰艦幾乎無敵，瞬息間可將敵軍的防御瓦解。

任務4：無盡深淵(Abyss)

由起始點往南找到水晶和金屬礦，讓隊中兩個Replicatorus完成克隆和轉化，云云可Copy和升級三四艘重型戰艦，然后率隊沿地圖的邊緣搜索，采集更多的資源以克隆戰艦，資源越多的地點仇人的防御越強，重點在于地圖的東北部。等擁有10余艘重量級的戰艦后，率部隊朝地圖的中央進攻，那里是USC的電廠所在地，將之摧毀，完成任務。

任務5：火星戰爭(Mars)

開始的任務是將一個女巫護送至西方的山谷，先將北方的戰艦調到東北山谷與Michael和女巫會集，然后護送女巫沿山道朝西方行進，途中會從各個方向受到敵軍的偷襲和阻擊，險象連生，要緩慢行進確保戰機不要離得過遠。進入山谷會發生激戰，擊退仇人的進攻后開始克隆部隊，這里有豐富的水源所以發展速度很快，但仇人會不斷騷擾。當隊伍行成范圍后率隊霸占其他水源，在地圖的西邊沿和西南角都有水源，將兵力發展至100以上，建議克隆能遠程投彈的蜘蛛和蛤蟆狀的坦克，在戰艦的配合下攻奪地圖南方的LC基地，進而攻打東南角的ED基地，全部摧毀，完成任務。

任務6：敵友難分(X-345)

服從博士的指示前去捕捉老朋友Ariah，經過改造后的Michael已將這段友誼忘得一干二凈。在起始點的水源相近克隆一定的兵力，率隊由南端小路往地圖的東部繞過去，避開正中的基地。在地圖東部找到水晶和金屬礦，將隊伍中的Replicatorus克隆并進化為重型戰艦，生產兩三艘便可朝地圖中央的LC基地發動進攻了。

Ariah和Lynn帶著Sebastian博士尋找脫離火星的方法，拾起起始點的藥包和定時炸彈，沿山道前行遇到小隊怪物，將山坡上的石頭打下來壓死它們。

任務7：幡然覺醒(Eden)

本關的行動要接受監督，博士的艦隊會一直隨行。在開始的水源地克隆異種部隊，發展約莫100名兵力往地圖的北部行進，分別在西方、北方和東方有人類的3座基地，找到其中一座會觸發劇情，Michael在Ariah的提示下有所覺醒，不過很多事仍然很模糊。接下來要朝Van Troff博士背叛一擊，在地圖的西北角有一個Replicatorus，將其克隆并進化為一支艦隊，隨后率軍前往正東方的基地，拆掉外圍的防御塔，殺掉墻里不斷跑動的Rifkin，這時基地里的士兵停火投誠并讓出道路。東南角是Tyranos的基地，有成片的異種巢穴，建議帶10艘巡洋艦過去，將整座基地摧毀，結束戰役。