生化奇兵3號稱耗資過億的作品，所以在很多人看來，這款作品具有非常的內涵，尤其是游戲中的宗教氣味比較濃烈，所以在玩這款游戲的時候要先了解一下圣經，要不然會對游戲比較難以理解。

宗教色彩解讀

升到天空城的第一個場景是一首贊美，Johnny cash唱過，in the circle.... by and by, by and by，這首贊美的主題是期待天國的降臨。

第一個場景一水為主題，如同圣經中約翰福音3:5節的內容“耶穌說：「我實實在在的告訴你，人若不是從水和圣靈生的，就不能進　神的國。 ” 門口那個白衣人也說了，這是在審判日之前的天國。

進門第一個場景的老人帶著一群人進入，新伊甸的那個畫面。

相信靈感來自于出埃及記，摩西帶領以色列人進入迦南地的記錄，而這里把這個帶大家進入天空城的“先知”升華到了救世主的程度。

后來在所謂的“圣母”房間里面，找到的錄音帶的錄音也是在說，“如果沒有罪救世主的救贖就沒有意義。。。。"。

這樣的教導自然是在放縱罪，感覺一個異端，一個邪惡的勢力正是他們。

后來進入到一個類似教堂的地方，那個講道人在宣揚贊美他們先知的世紀，他們先知時如何帶領他們到哥倫比亞，如何教導他們，如何犧牲了自己的最愛。（引用圣經里耶穌的職分，先知，祭司，王。分別是傳講圣道，犧牲，帶領并建立。）

那個講道人強制給主角洗禮，并且他還宣稱下面的世界為所多瑪和蛾摩拉（圣經中亞伯拉罕時代的罪惡城市，再多出被引用）。

他給主角洗禮了兩次，這也暗示了這個異端的嘴臉。（可以參考異端anabaptist）